Pembunuhan Sultan dan Jatuhnya Benteng Ternate
Komunitas Portugis di Maluku terkonsentrasi di Ternate. Komunitas ini terdiri dari sekitar 40 hingga 50 pemukim (vizinhos) yang tinggal di kompleks terpisah di samping benteng. Mereka bukan komunitas yang harmonis yang bersatu dalam tujuan politik dan ekonomi yang sama. Sebagian besar dari mereka tidak memiliki hubungan baik dengan penduduk asli. Namun, beberapa di antara mereka, orang-orang kaya dan berpengaruh, terkait melalui ikatan kekerabatan dengan elit lokal. Faktanya, pada akhir 1560-an, sekelompok casados yang berkuasa bertindak sebagai penasihat Sultan Hairun, sementara sebagian besar pemukim Portugis dianiaya oleh otoritas Muslim di seluruh kepulauan. Kelompok pertama termasuk, misalnya, Paulo de Lima, kemungkinan seorang keturunan campuran yang menjadi “kepala” dan menikah dengan keponakan Sultan Tidore yang telah dikristenkan. Karena pernikahan ini, Paulo de Lima menjadi tuan tanah beberapa desa di Pulau Motiel dan kerabat Hairun. Casados kaya ini adalah pemukim generasi kedua keturunan Eropa.
Generasi pertama telah menetap oleh gubernur Antonio Galvão pada masa awal. Mereka memainkan peran penting dalam mendukung Hairun. Dengan kata lain, aliansi biasa melalui pernikahan antara elit regional dan penguasa Maluku diperluas untuk mencakup komunitas Portugis. Generasi pertama casados termasuk Henrique de Lima dan Manuel da Silva, yang oleh M. A. Lima Cruz ditambahkan Gonçalo Fernandes Bravo dan Baltazar Veloso, keduanya menikahi saudara perempuan Hairun, serta Antonio Ribeiro dan Lopo Ribaldo, yang juga terkait melalui ikatan kekerabatan dengan Sultan Ternate.

Pada tahun 1575, Portugis menarik diri dari Ternate, setelah konflik panjang dengan Kesultanan lokal. Penulis kontemporer mengutuk gubernur Diogo Lopes de Mesquita atas ketidakbijaksanaannya, karena ia memerintahkan pembunuhan Sultan Hairun pada tahun 1570, meskipun Hairun dianggap sebagai “sekutu terpercaya” Portugis. Namun, faktanya, Sultan jauh dari menjadi vassal setia mahkota Portugis, dan mengikuti kebijakan yang ambigu terhadap Portugis. Sikap ini menjadi lebih jelas pada tahun-tahun terakhirnya. Hubungan saling memburuk setelah Hairun meningkatkan penganiayaan terhadap komunitas Kristen di Moro. Wilayah ini mencakup, seperti yang telah disebutkan, Morotai di barat laut Halmahera, Pulau Morotia di utara, dan beberapa pulau kecil, yang terpenting adalah Rau.
Komunitas Kristen di pulau-pulau ini terdiri dari sekitar delapan puluh ribu jiwa dan dua puluh sembilan desa. Moro adalah pengekspor utama beras dan sagu. Kesuburan tanahnya, terutama di Morotai, adalah hasil dari datarannya, sementara sebagian besar pulau tetangga lainnya berbukit. Selama beberapa abad, Moro telah didambakan oleh semua raja Maluku. Kepemilikannya memberikan hak dan kekuasaan untuk menuntut bahan makanan dan memungut upeti.
Perselisihan dan perang yang terus-menerus menyebabkan penduduk asli mencari perlindungan dari misionaris dan Portugis, yang juga bisa mendapatkan akses ke persediaan di Moro. Pada masa awal, misi Jesuit di Moro dan penduduk Kristen lokal dianiaya oleh Sultan Jailolo, penguasa Halmahera Tengah, tepat di selatan Moro. Setelah dikalahkan oleh Portugis pada tahun 1550-1551, Jailolo menyerang Moro pada tahun 1558 dengan dukungan Hairun. Dari tahun 1562 hingga 1566, ada beberapa tanda-tanda perdamaian, sehingga pekerjaan misionaris dapat berjalan. Tetapi pada tahun 1566, Sultan Ternate memerintahkan penganiayaan keras yang belum pernah terjadi sebelumnya, yang menjadi cukup teratur sejak tahun 1569. Sesuatu yang serupa telah dipraktikkan di Ambon. Mungkin Sultan berusaha, dengan cara ini, untuk menyeimbangkan pengaruh yang dicapai oleh Gonçalo Pereira Marramaque di Maluku tengah-selatan.
Strategi Hairun melawan Portugis akhirnya dipahami oleh Marramaque. Setelah beberapa keraguan, ia memutuskan untuk menangkap Sultan dan dengan demikian memulihkan pengaruh yang telah hilang dari Portugis. Beberapa casados, kerabat Sultan, memberi tahu Hairun, sehingga ia dengan mudah bisa menghindari rencana Marramaque. Pada tahun 1570, Hairun juga diberitahu tentang rencana lain untuk pembunuhannya, yang diajukan oleh gubernur Ternate, Diogo Lopes de Mesquita. Urusan rahasia ini bocor dari dewan oleh beberapa penduduk Portugis paling terkemuka. Dalam pertemuan itu, Francisco de Sousa mengaitkan kepada gubernur sebuah pidato, diucapkan di hadapan rekan-rekannya, yang merangkum semua pengkhianatan Hairun.
Meskipun ada keterlibatan dan ikatan kekerabatan antara komunitas Portugis dan Sultan, ia dibunuh atas perintah gubernur. Karena pembunuhan Hairun, Kesultanan Ternate, yang sebelumnya merupakan “vassal” dan “sekutu” utama Portugis, menjadi musuh mereka yang paling kuat. Otoritas lokal memerangi Portugis selama lima tahun, akhirnya mengusir mereka dari pulau itu. Almarhum P. R. Abdurachman berpendapat bahwa jihad atau perang suci melawan Portugis diumumkan segera setelah kematian Hairun. Namun, versi yang berbeda diberikan oleh Argensola. Menurutnya, baru pada tahun 1572 sebuah konfederasi dari semua raja dan sengaji Maluku dibentuk melawan Portugis, yang kepemimpinannya tidak ada putra Hairun yang berani ambil alih, tetapi diterima oleh Baab Ullah, Sultan baru Ternate. Di sisi lain, sumber-sumber Portugis dan misionaris merujuk pada pemberontakan di seluruh Kepulauan Timur, yang mengakhiri perselisihan internal. Peristiwa serupa terjadi pada tahun 1557, ketika gubernur Portugis menangkap Hairun.
Beberapa penjelasan budaya dan ideologis telah ditemukan untuk membenarkan reaksi sosial dan politik ini. Pertama, raja-raja Ternate dan Tidore mengklaim sebagai keturunan ilahi. Kedua, Pulau Ternate adalah bagian—yang utama, karena dikatakan sebagai pusat—dari wilayah sakral yang jauh lebih luas, melampaui Maluku itu sendiri. Portugis bersikeras pada pembagian geopolitik wilayah tersebut, mengabaikan ikatan mitis antara kerajaan-kerajaan. Mereka hanya mengetahui ikatan kekerabatan yang rumit di antara keluarga kerajaan yang menawarkan pola politik yang tidak konsisten. Pembunuhan raja oleh orang asing adalah pelanggaran terhadap gagasan, yang berakar kuat dalam tradisi, bahwa Sultan Ternate adalah raja dari segala raja di Maluku dan bahwa pribadinya adalah sakral dan tidak dapat dilanggar.
Di sisi lain, penulis Spanyol, khususnya Gaspar de San Agustin, dengan jelas mencatat bahwa pembunuhan Hairun digunakan oleh orang-orang Ternate sebagai dalih untuk membalikkan keadaan melawan Portugis. Di dalam keluarga kerajaan sendiri, ada faksi yang cenderung melakukan perlawanan yang lebih kuat terhadap Portugis. Pembunuhan Sultan sangat menguntungkan bagi faksi politik ini yang memperoleh kekuasaan dan merampas garis keturunan kerajaan yang sah. Fakta ini sebagian memengaruhi kebijakan Portugis selanjutnya.
Sejak saat itu, faksi lama yang kehilangan kekuasaan berpindah ke “oposisi”, berkumpul di sekitar garis keturunan yang sah. Kelompok ini setuju untuk membuat beberapa konsesi kepada Portugis, termasuk, setelah tahun 1575, untuk mengembalikan benteng kepada mereka, sebagai imbalan atas dukungan untuk memulihkan mahkota. Oposisi domestik di Ternate juga berkonspirasi dengan otoritas Tidore. Menurut Couto, Sultan Ternate, Baab Ullah, memerintahkan pembunuhan pewaris yang juga saudaranya sendiri. Gubernur Maluku, Duarte Pereira, yang kini tinggal di Tidore, menemukan ini sebagai saat yang tepat untuk memulihkan Ternate, merancang skema dengan Kachil Tulo, “Bupati Kerajaan”, dan saudara Sultan. Pereira mengajukan hak suksesi Kachil Tulo, memanfaatkan kemarahan umum di Maluku yang disebabkan oleh pembunuhan pangeran yang diperintahkan oleh Sultan. Argensola menyajikan versi yang berbeda. Menurutnya, setelah kematian Hairun, gubernur baru, Nuno Pereira de Lacerda, menawarkan takhta Ternate kepada Kachil Guarate, putra tertua Hairun.
Sementara itu, setelah ekspedisi Marramaque menarik diri dari Maluku, orang-orang Asia mencapai supremasi angkatan laut atas laut-laut Kepulauan Timur. Di Ternate, Portugis bergantung pada persetujuan Sultan untuk mendapatkan akses ke bahan makanan dari Moro. Sultan, di sisi lain, sering mengganggu jalur pasokan. Benteng belum jatuh sebelumnya karena raja Tidore, memutuskan aliansinya dengan Ternate, secara diam-diam memasok Portugis yang terkepung di balik tembok. Selama pengepungan, kedua belah pihak tetap menjalin negosiasi untuk perdamaian. Akhirnya, ketika garnisun menyerah, Sultan Baab Ullah mempertahankan benteng atas nama raja Portugal, sebuah peristiwa yang belum pernah terjadi sebelumnya dan mengejutkan. Pasukan penguatan yang dikirim dari Goa tiba terlambat dan tidak cukup kuat untuk memulihkannya.
Goa meninggalkan Maluku pada nasibnya, seperti halnya gubernur mengabaikan pertahanan “penaklukan” yang juga merupakan tempat bagi orang-orang buangan dan terpidana. Di sisi lain, pada saat yang sama, wilayah Portugis di India mengalami beberapa serangan—pengepungan Goa, Chaul, dan Chaliyam—yang menghambat bantuan yang memadai dari wakil raja. Sebuah armada yang terdiri dari empat kapal berangkat dari Goa pada tahun 1574, tetapi tiba di Ternate tepat setelah benteng menyerah. Secara keseluruhan, tiga ekspedisi penyelamatan dikirim ke Maluku dalam periode tujuh tahun, tanpa hasil positif.
Meskipun Portugis menunjukkan beberapa minat untuk memulihkan pengaruh mereka di Maluku, dapat disimpulkan bahwa Portugis menunjukkan kecenderungan yang relatif kecil terhadap penaklukan, memprioritaskan perdagangan daripada usaha militer. Ini berbeda dengan Spanyol: “Hal pertama yang dilakukan Kastilia ketika mereka menaklukkan [suatu wilayah] adalah membunuh orang-orang terkemuka dan mengubah orang lain ke agama Kristen, tidak seperti kami [karena] hal pertama yang kami kejar adalah perdagangan cengkeh dan [baru] kedua agama Kristen.” Bagi para imam Jesuit, setelah jatuhnya benteng Ternate, Maluku kehilangan nilainya sebagai wilayah misi. Jadi mereka semakin mengalihkan perhatian mereka ke Jepang.
Pada tahun 1574, tepat sebelum jatuhnya Ternate, Portugis juga mengalami beberapa masalah di Kepulauan Banda. Kehilangan prestise mereka memberi keberanian kepada orang-orang Banda untuk lepas dari pengaruh mereka dan menyerang mereka. Di Maluku, Portugis memiliki pabrik kerajaan dan benteng, tetapi kehadiran mereka di Banda memiliki pola yang berbeda. Di sini, kehadiran Portugis terbatas pada kunjungan musiman oleh agen Mahkota dan pedagang swasta, meskipun ada beberapa pedagang yang tinggal di Pulau Neira. Pola serupa juga dapat ditemukan di Kepulauan Solor pada masa awal.
Pada pertengahan 1570-an, dua blok politik muncul di Kepulauan: yang pertama dipimpin oleh Ternate, yang lain menggabungkan Tidore dan Banda. Namun, meskipun beberapa anggota keluarga kerajaan Tidore yakin bahwa mereka harus membantu Banda untuk melawan Portugis, Sultan memiliki pendapat yang berbeda. Karena kebijakan Tidore ambigu, Banda akhirnya berpindah ke sisi Ternate, terutama setelah Portugis membangun benteng di Tidore dengan izin Sultan. Sejak itu, kehadiran Portugis di Banda bergantung pada penyerahan Ternate: “Jika Maluku ini menyerah, begitu juga Banda.”
Setelah tahun 1575, otoritas Ternate memperbanyak benteng di pulau mereka sendiri, serta di wilayah-wilayah jajahan mereka. Kesultanan menerima pasokan, termasuk artileri, dari Johor, yang juga bersekutu dengan Banda. Ini berarti bahwa kesulitan yang dialami Portugis di Maluku tidak terisolasi dari konflik yang mereka hadapi di dunia Melayu barat. Dalam beberapa hal, masalah di Ternate adalah perpanjangan dari perang antara Portugis dan kesultanan-kesultanan saingan. Peristiwa-peristiwa ini menyoroti adanya koalisi anti-Portugis yang menghubungkan kekuatan Muslim di seluruh Samudra Hindia. Aceh adalah penghubung ke Samudra Hindia Barat, sementara Johor adalah penghubung rantai Muslim ke Jawa dan Kepulauan Timur.